个人所得税重复申报退税是无效的，对于重复申报的退税申请是不可以通过的，有关个人所得税的法律依据是：
根据《财政部国家税务总局关于基本养老保险费基本医疗保险费失业保险费住房公积金有关个人所得税政策的通知》的规定，个人按照国家或省(自治区、直辖市)人民政府规定的缴费比例或办法实际缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费和失业保险费，允许在个人应纳税所得额中扣除。
根据《税收征收管理办法》第五十一条的规定，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还;纳税人自结算缴纳税款之日起3年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后应当立即退还;涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。因此，多缴纳的个人所得税可向主管税务机关申请退还。
一、个税申报操作流程
个税申报操作方式：
1、通过扣缴义务人申报：这主要是指一些以工资薪金收入为主要收入来源的工人，有扣缴义务人，即用人单位预扣个人所得税；
2、综合所得年度自行申报：这是指工资薪金、劳务费、稿酬、特许权使用费四项收入的综合收入。
扣缴义务人每月或者每次预扣、代扣的税款，应当在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴个人所得税申报表，纳税人办理汇算清缴退税或者扣缴义务人为纳税人办理汇算清缴退税的，税务机关审核后，按照国库管理的有关规定办理退税。
二、房屋契税可以退税吗
房屋契税符合一定条件下可以退税，具体如下：
1．纳税人已经按照预售面积、预售房款缴纳契税，但是办理房产证时，发现实测面积和预售面积有误差，导致房款发生变化，导致纳税人多缴税款的，那么可以申请退税；
2．纳税人超过需要纳税额缴纳的税款，税务机关发现后要马上退还；
3．纳税人自结算缴纳税款之日起三年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款，并且加算银行同期存款利息，税务机关及时查实后要马上退还。