当员工申请离职时，处理其敏感个人信息是非常重要的。首先，要确保员工的个人信息安全，可以通过以下几个步骤来处理：
数据保护：在员工离职前，确保所有员工的个人信息都被妥善保护。这包括在电脑和文件中存储的个人信息，以及公司内部系统中的信息。可以考虑对离职员工的访问权限进行限制，以防止个人信息被滥用。
文件归档：将离职员工的个人文件进行归档，并设立专门的存档区域进行储存。这可以帮助公司在有需要时快速找到离职员工的信息，同时也能够避免信息泄露的风险。
合规处理：根据当地的数据保护法律和法规，确保离职员工的个人信息处理合乎法律要求。这可能涉及到通知员工关于他们个人信息的处理方式、存储期限等事项。
数据销毁：在一定的时间后，根据公司的数据保留政策，对离职员工的个人信息进行安全的销毁。这可以通过文件碎纸机对纸质文件进行销毁，通过数据擦除软件对电子数据进行销毁等方式来实现。
员工教育：在员工入职培训中，可以向员工介绍公司对个人信息的保护政策，包括离职员工个人信息的处理方式，让员工对信息安全有充分的认识。
以上是处理离职员工敏感个人信息的一些建议，公司需要建立完善的个人信息保护制度，确保员工个人信息的安全和合规处理。