不论是股东自愿转让股权还是由法院强制股东转让股权，对转让价格的确定都是股权转让中一个十分重要的方面。股东和受让方间对确定股权转让价格的方法常常不科学，并不能接近股权的价值和市场价格。确定股权转让价格的方法不同，将直接影响股权转让价格，从而影响公司、股东和受让方的利益。
实践中，确定股权转让价格通常有几种做法：
（1）将股东出资时股权的价格作为转让价格；
（2）将公司净资产额作为转让价格；
（3）将审计、评估价格作为转让价格；
（4）将拍卖、变卖价作为转让价格；也有采用其他方法来确定转让价格的。
上述几种方法，都有其可取之处，但也存在不足。将出资额和公司净资产额作为股权转让价格简单明了，便于计算和操作；审计、评估方法通过对公司会计账目、资产的清理核查，较能体现公司的资产状况；拍卖、变卖的方法引入了市场机制，在一定程度上能体现股权的市场价值。但是，公司的生产经营活动受经营者的决策及市场因素的影响较大，公司的资产状况处于一种动态变化之中，股东的出资与股权的实际价值往往存在较大差异，如对股东的股权未经作价以原出资额直接转让，这无疑混淆了股权与出资的概念；公司净资产额虽然反映了公司一定的财务状况，但由于其不体现公司资金的流转等公司运作的重要指数，也不能反映公司经营的实际情况；审计、评估能反映公司财产状况，也能对公司运作的大部分情况进行估算，却不能体现公司的不良资产率、公司发展前景等对股权价值有重要影响的因素；拍卖、变卖一般时间较紧，转让方和受让方常无法进行更多直接沟通。如不能很好理解和运用这几种方法，将造成股权的滥用，侵犯股东和公司的合法权益。
法律并未要求股权转让价格不低于出资额，股权并购中，若出现股权转让备案登记的虚假股权转让价款与真实价款不相一致时，并购各方应注意采取相应措施保全证据，还原一个真实的股权转让价款，以防控法律风险。
一、自然人股权转让根据什么报价
当前，我国相关法律除了对国有股权的转让估价作了限制性规定外，对于普通股权转让价格的确定并未作具体的规定。根据意思自治原则，只要当事人不违反法律的强制性规定，不损害国家和第三人的合法权益，法律允许股东自由确定股权转让价格。
在法律实践中，普通股权的转让价格通常由以下几种方式确定：
（1）当事人自由协商确定，即股权转让时，股权转让价款由转让方与受让方自由协商确定，可称为“协商价法”。
（2）以公司工商注册登记的股东出资额为股权转让价格可称为“出资额法”。
（3）以公司净资产额为标准确定股权转让价格，可称为“净资产价法”。
（4）以审计、评估的价格作为依据计算股权转让价格，可称为“评估价法”。
（5）以拍卖价、变卖价为股权转让价格。