拜仁慕尼黑的死敌球队当属异国的阿森纳和巴塞罗那，而在德国联赛中，拜仁最大的死敌则是汉堡。
自从拜仁慕尼黑成立以来，汉堡就一直是拜仁最大的死敌。两队曾经进行过多次激烈的较量，最著名的一次是在2009年，拜仁和汉堡在拜仁的家乡慕尼黑展开了一场精彩的德甲锦标赛决赛，最终拜仁以1:0的比分获胜。
另外，拜仁也和阿森纳有着长期的死仇，这也是拜仁最激烈的死敌之一。两队曾经在2005年的欧冠赛场上进行了一场角逐，最终拜仁以2:2的比分被阿森纳淘汰出局。
最后，拜仁也和巴塞罗那有一个漫长的死仇，尤其是在2013年的欧冠决赛中，拜仁以1:2的比分惨败于巴塞罗那，让拜仁球迷深感失望。
总之，拜仁慕尼黑和阿森纳、汉堡和巴塞罗那之间曾经有着激烈的死仇，而这也是拜仁球迷最熟悉的死敌球队。