法律分析：土地承包协议是农村土地承包经营的重要依据，其中规定了各方的权利和义务。在土地承包协议中，可以规定耕地质量标准，以保障土地的有效利用和保护农业生产环境。但是，需要注意的是，协议中的规定不能违反土地法律规定和国家政策，同时需要考虑到农民的经济承受能力。
法律依据：
1.《中华人民共和国土地管理法》第三十一条：关于土地质量，国家可根据土地利用和管理的需要，制定土地分类标准，规定合理的利用强度和耕作制度。
2.《中华人民共和国农村土地承包法》第十三条：农村土地承包经营合同确定耕地质量，并考虑先前土地承包情况、整地情况、土壤肥沃程度、水利条件、气候条件等因素。
3.《中华人民共和国合同法》第九十五条：当事人订立的合同不得违反法律、法规的规定，不得违背社会公共利益，不得损害他人的合法权益。
以上是土地承包协议中规定耕地质量标准时需要遵循的法律规定。需要特别强调的是，土地质量标准的制定应当具有科学性和合理性，以确保耕地的保护和有效利用。
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