股权协议书若是公司法人作为股东购买或者是转让股权，则需要加盖公章。自然人股东转让股权时不需要加盖公章。股权转让协议应当写明当事人的姓名或者名称、变更登记的时间、股权转让款支付的时间、方式以及争议解决方式等。
一、怎么确认股权转让溢价
股权转让后，如果转让所得的价款大于股东投资时的出资，股权转让就存在溢价，转让人要申报个人所得税。具体确认方法如下：
1、协商作价法，由股权的转让方和受让方按照意思自治的原则协商确定股权转让价格；
2、出资额法，按公司工商注册登记时的出资额来确定股权价格；
3、净资产法，按公司某一时点经审计的净资产值或根据该净资产值进行适当的溢价来确定股权的价格；
4、市盈率法，股权转让价款按照公司的净利润乘以一定倍数的市盈率计算确定。
一、公司股权转让所需要的资料如下：
1、 需要填写公司变更登记申请表并且盖章；
2、 还需要携带全体股东签字并且加盖公章的公司章程修正案；
3、 需要提供全体股东签字加盖公章的股东会决议；
4、 要提供公司营业执照正副本原件；
5、 需要提供全体股东身份证复印件；
6、 要提供股权转让协议原件。
二、股权转让的具体流程如下：
1、 召开股东会议。公司的股权在发生转让之前必须要召集全体股东来开股东会议，会议主要商讨的是股权转让是否对公司的发展有利，是否可以股权转让；
2、 需要双方进行谈判。股权转让方以及股权受让方需要进行谈判以及协商；
3、 签订股权转让合同。需要先前往产权交易中心对合同以及附件进行审查，同时还需要办理股权转让相关手续，股权转让方和受让方签订股权转让合同以及股权转让协议书等相关资料；
4、 办理变更手续。需要前往相关部门填写公司变更登记申请书，然后要有法人代表签字以及盖章，需要提供法定代表人的身份证原件；
5、 变更营业执照，需要前往相关的部门来变更营业执照，主要包含了填写公司变更表格并且加盖公章，另外还需要整理公司章程修正案，股权转让协议等；
6、 变更组织机构代码，变更税务登记证，另外还需要变更银行信息。
总而言之，股权转让后，如果转让所得的价款大于股东投资时的出资，股权转让就存在溢价，转让人要申报个人所得税。具体确认方法有协商作价法、出资额法、净资产法和市盈率法。
二、公司法定代表人该如何变更
公司法定代表人变更的程序为：
1、领取《公司变更登记申请表》；
2、变更营业执照，填写公司变更表格，加盖公章，整理章程修正案、股东会决议、承诺书、公司营业执照正副本原件、到工商局办证大厅办理；如果存在股权转让须填写股权转让协议；
3、变更组织机构代码证，填写企业代码证变更表格，加盖公章；
4、变更税务登记证；
5、变更银行信息。
企业法人申请变更登记，应当在主管部门或者审批机关批准后30日内，向登记主管机关申请办理变更登记。企业法人改变名称、住所、经营场所、法定代表人、经济性质、经营范围、经营方式、注册资金、经营期限，以及增设或者撤销分支机构，应当申请办理变更登记。
三、关于公司股权变更流程怎么走
公司股权变更手续如下：1.公司受让股权召开公司股东会。2.出让和受让方进行实质性的协商和谈判。3.评估、验资。4.股权转让的公司召开股东会，并形成股东会决议。5.向股东以外的第三人转让股权的，由转让股权的股东向公司董事会提出申请，由董事会提交股东会讨论表决;股东之间转让股权的，通知公司及其他股东。股东对股权转让给第三方放弃优先购买权，出具放弃优先购买权的承诺或者证明。6.双方签订股权转让协议，对转让股权的数额、价格、程序、双方的权利和义务做出具体的规定。7.召开新股东会议。8.收回原股东的出资证明，发给新股东的出资证明，对公司股东名册进行变更登记，注销原股东名册，将新股东相关信息记载于股东名册，并相应修改公司章程。9.将新修改的公司章程，股东及出资变更等向工商行政管理部门进行工商变更登记。
【本文关联的相关法律依据】
《公司法》第七十一条
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。
股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。
第一百三十九条
记名股票，由股东以背书方式或者法律、行政法规规定的其他方式转让；转让后由公司将受让人的姓名或者名称及住所记载于股东名册。
股东大会召开前二十日内或者公司决定分配股利的基准日前五日内，不得进行前款规定的股东名册的变更登记。
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