工程合同终止时会失效，合同约定期限届满的、合同标的全部灭失的、已经完全履行合同义务的、合同主体行使合同终止权的、合同解除的，工程合同依法终止。
《中华人民共和国民法典》第五百五十七条有下列情形之一的，债权债务终止：（一）债务已经履行；（二）债务相互抵销；（三）债务人依法将标的物提存；（四）债权人免除债务；（五）债权债务同归于一人；（六）法律规定或者当事人约定终止的其他情形。合同解除的，该合同的权利义务关系终止。
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