不可以。灵活就业者参与社保后生孩子的，医保是不会报销相关费用的；因为生孩子产生的费用应当有生育保险报销，而灵活就业社保通常只要求参保人员缴纳养老保险和医疗保险，不缴纳生育保险、失业保险和工伤保险，所以生孩子的时候自然也就没有生育保险能够用来报销
当然，虽说以灵活就业人员的身份参保社保无法报销生育费用，但因为参保人员还是缴纳有医疗保险，所以生孩子住院期间的一些医疗费用还是能够用医保报销一部分的。
如果希望生育费用能够报销的话，最好去缴纳职工社保，毕竟居民社保也只要交养老保险和医疗保险；或者通过挂靠单位的方式来交社保也行，这样也能够缴纳生育保险，也就可以报销生育费用。
灵活就业人员可选择参加职工医保或城乡居民医保，不参加生育保险。发生的生育医疗费用按其所参加的基本医疗保险待遇政策及基金支付，不享受生育津贴。但是可以以别的方式享受一下有关的生育福利。新生儿医保办理：
1.在户籍地：在派出所上户口，带着宝宝出生证、户口本、父母双方身份证、结婚证，到户籍地街道或社保中心直接办理。
2.不在户籍地：父母双方至少有一人持有当地的居住证，回到户籍地给宝宝上户口，带着宝宝出生证、户口本、父母双方身份证、结婚证，到所在地街道或社保中心办理。
法律依据
《社会保险法》第五十四条规定：“用人单位已经缴纳生育保险的，其职工享受生育保险待遇；职工未就业配偶按照国家规定享受生育医疗费用待遇。 所需资金从生育保险基金中支付。 ”
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